El Claustro presenta columnas pareadas de mármol adornadas por arcos.
En la capilla mayor se sitúa el retablo mayor obra de Felipe de Rivas del siglo XVII con policromías de Lucas Valdés presidido por el Santo Titular.
En la nave de la iglesia se sitúa el retablo de "San Juan Bautista" obra de Ocampo presidido por efigies de Gaspar Nuñez y pinturas de Francisco Pacheco.
En la entrada del templo, Valdés Leal realizó un lienzo donde se representa "La entrada de San Fernando en Sevilla".
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